? 22 يوليو
؟ 12:00 – 13:00 بالتوقيت العالمي المنسق
اللغة: ماثيو باشتون
تعيين: نواب رئيس الجامعة الكبار Fellow
انتساب : مركز التكنولوجيا الحيوية في البيئة المبنية ، قسم العلوم التطبيقية ، كلية الصحة وعلوم الحياة ، جامعة نورثمبريا ، نيوكاسل أبون تاين ، المملكة المتحدة
الدكتور ماثيو باشتون هو خبير المعلومات الحيوية الرئيسي لفريق COVID-19 Genomics UK Consortium (COG-UK) بجامعة نورثمبريا. سيصف حديثه إعداد البرامج والبيئة المستخدمة في نورثمبريا لتقديم حل الجينوم الخاص بـ COVID-19 والمتغير وتصنيف النسب ، بما في ذلك خطوط الأنابيب المطورة بالإضافة إلى الأدوات الأخرى المستخدمة داخل COG-UK. نجح الفريق في نورثمبريا في تسلسل أكثر من 16,000 جينوم COVID-19 يساهم في كل من المراقبة الجينية على المستوى الوطني والمشاركة في تحقيقات الفاشية المحلية حيث ساعدت الجينوميات في تتبع انتشار الفيروس بين الناس وإبلاغ جهود مكافحة العدوى. سيتحدث ماثيو عن التحدي المتمثل في بناء بيئة برامج إنتاج وصيانتها ، كما تستخدمها ، في مشهد سريع التطور ومتطور باستمرار.
الدكتور ماثيو باشتون هو عالم بيولوجي حسابي ، يتمتع بخبرة واسعة في مجال المعلوماتية الحيوية والكيميائية والسريرية ، مع خبرة محددة في مجالات البروتينات ، وهيكل البروتين ووظيفته ، وتفاعلات بروتين الترابط ، وتحليل التسلسل عالي الإنتاجية ، وتحليل الجينوم ، والعلامات الحيوية. اكتشاف.
حصل ماثيو على درجة البكالوريوس في الكيمياء الحيوية من جامعة نيوكاسل. حصل على درجة الدكتوراه في مجال الجينوميات الهيكلية في مختبر MRC للبيولوجيا الجزيئية في كامبريدج في مجموعة الدكتور سايروس كوثيا FRS. ركزت رسالة الدكتوراه الخاصة به على كيفية تجتمع العائلات المختلفة في مجال البروتين معًا هندسيًا ونحويًا لتحقيق الوظائف على مستوى البروتين الكامل.
عمل ماثيو كباحث Fellow في مجموعة البروفيسورة دام جانيت ثورنتون، زميلة الجمعية الملكية، بالمعهد الأوروبي للمعلوماتية الحيوية (EBI)؛ حيث كان جزءًا من اتحاد مركز الغرب الأوسط لعلم الجينوم البنيوي (MCSG) الممول من وزارة الطاقة الأمريكية. أثناء عمله في المعهد الأوروبي للمعلوماتية الحيوية، طوّر ماثيو قاعدة بيانات PROCOGNATE التي تربط عائلات نطاقات البروتين بمجموعة الروابط المتجانسة التي ترتبط بها. كما عمل على كاشف الرسم البياني الفرعي الجزيئي الصغير (SMSD) الذي يُمكّن من مطابقة سريعة ودقيقة للرسوم البيانية ثنائية الأبعاد، سواءً الكيميائية أو الشظايا. بعد عمله في المعهد الأوروبي للمعلوماتية الحيوية، انتقل ماثيو للعمل في وحدة دعم المعلوماتية الحيوية بجامعة نيوكاسل، حيث اكتسب خبرة واسعة في العمل مع بيانات التسلسل عالي الإنتاجية (HTS) في مجموعة من مشاريع الجينوم مع العديد من الباحثين الرئيسيين المختلفين في كلية الطب. انتقل بعد ذلك إلى أبحاث جينوميات السرطان حيث عمل في المعهد الشمالي لأبحاث السرطان (NICR) في نيوكاسل، حيث قام بتطوير مجموعة متنوعة من خطوط أنابيب تحليل الحوسبة عالية الأداء لتحليل الجينوم الجسدي والإكسوم، إلى جانب مشاريع تصنيف المخاطر والمجموعات الفرعية القائمة على المؤشرات الحيوية حول أورام المخ وسرطان الدم عند الأطفال.
يعمل ماثيو الآن في المركز متعدد التخصصات للتقنية الحيوية في البيئة المبنية (HBBE) ، حيث يعمل مع مجموعة من المصممين والمهندسين المعماريين والمهندسين وعلماء الأحياء الاصطناعية والجزيئية لتعزيز تشييد المباني والاستدامة والصحة البيئية للبيئة المبنية باستخدام علم الأحياء.
في 2020-2021 ، أصبح ماثيو عضوًا في جهود علم الجينوم COVID-19 في المملكة المتحدة ، حيث عمل جنبًا إلى جنب مع فريق في جامعة نورثمبريا لتسلسل 16,000 جينوم COVID-19 من 7 مستشفيات مختلفة عبر الشمال الشرقي وكمبريا.
